Myôjin Yahiko est le descendant d'une famille de samouraï de Tokyo. Son père avait refusé de trahir le Bakufu et s'était présenté comme volontaire dans l'armée de Shôgi-tai ou il y est mort, quand à sa mère, elle s'est sacrifiée pour l'élever et est morte d'une maladie suite au surmenage. Il est donc recueilli par des Yakuzas. A 10 ans, il travaille pour eux comme pick pocket. Un jour il se heurte à Kenshin. Celui-ci lui dit alors une chose qui lui permit de se remettre en question, lui permettra de suivre une autre direction et surtout de rompre les liens avec les Yakuzas. N'ayant nul part ou aller, il fini par s'installer chez Kaoru. Yahiko est un enfant déjà très mature pour son âge, son apprentissage du Kendo commence alors, avec comme maître Kaoru (puisque Kenshin ne veux pas perpétuer l'enseignement de l'école Hiten Mitsurugi Ryu). Son but est de devenir aussi fort que Kenshin afin de se défendre tout seul et ainsi protéger les gens qu'il aime. Son admiration pour Kenshin va le pousser à trouver un travail pour pouvoir se procurer son propre sabre à lame inversée. Tous comme Kaoru, il a un tempérament de feu ce qui provoque des disputes sans fin, mais au fond ils partagent une grande complicité...